Попечительский совет является органом, осуществляющим надзор за деятельностью Центра, принятием другими органами Центра решений и обеспечением их исполнения, использованием средств Центра, cоблюдением законодательства.
Директор Центра является постоянно действующим исполнительным органом Центра, руководящим текущей научной и финансово-хозяйственной деятельностью.
Сайт Центра подводных исследований переведен на адаптивный дизайн.